Madrasah Aliyah Negeri 2 Kota Bekasi merupakan Sekolah menengah umum yang berciri khas agama Islam yang berasal dari MAN Jatiasih ( tahun 1996 - 2002 ) berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama Nomor 515A Tahun 1995 tentang Pembukaan dan penegerian Madrasah yang berasal dari MAN Jatiasih yang berlokasi di jalan Hj Gemin no.63 Kelurahan Jatikramat Jatiasih Kota Bekasi menjadi MAN 2 Kota Bekasi dengan SK Menteri Agama RI Nomor 523 yang berlokasi di jalan Bojong Asih V Rt.007/Rw.017 Perum Narogong Indah Rawa Lumbu Kota Bekasi.

Dalam Perjalanannya yang telah 27 tahun ini tetap komitmen pada aturan yang berlaku yang kemudian dikembangkan  dengan arah kebijakan Madrasah serta pendayagunaan potensi tenaga edukatif, tenaga administratif serta fasililitas sarana yang ada di MAN 2 Kota Bekasi telah menunjukkan jati diri dapat menghasilkan lulusan yang menggembirakan. Hal ini dapat dibuktikan dengan berbagai keberhasilan yang dicapai peserta didik.

Dekimian pula sebagai arah timbal balik hubungan Madrasah dengan Masyarakat MAN 2 Kota Bekasi telah menunjukkan perhatian serta kepercayaan masyarakat yang semakin positif, hal ini pun dapat dibuktikan dengan peminat siswa dari tahun ke tahun yang terus meningkat sehingga dalam penerimaan siswa baru diadakan seleksi  melalui batasan nilai hasil ujian.

Kendati demikian sebagai suatu proses usaha yang menghadapi berbagai heteroginitas dalam komponen - komponennya, maka tidak menutup mata terhadap kekurangan - kekurangan yang perlu di sempurnakan. Oleh Karena itu dalam mengoperasikan usaha pendidikan Pada Madrasah Aliyah Negeri 2 Kota Bekasi, secara berkesinambungan pimpinan Madrasah serta seluruh Mitra Kerjanya senantiasa saling mendukung.